miniconda的安装与配置_NCL2Python|windows系统安装Pyngl和Pynio

自从NCL停更之后，python的知名度都不断提高了，我也开始了python学习之旅，但是还没开始，就被如何安装Pyngl和Pynio给困住了。网上和官网给的教程都是Linux系统或者OS系统，有老板服务器的同学压根不用担心这个问题，没有任何影响。但是没有服务器就有点惆怅了。

为什么Windows不能直接安装

我想到电脑上安装了Aanconda，那能不能安装PyNIO和PyNgl呢，果不其然出错了，这到底是什么原因？我接着输入anaconda search -t conda pyngl，查看pyngl各个版本信息，发现4个pyngl和pynio安装包根本就没有windows系统的版本，而windows里面安装的环境都是windows下的。因此这就是导致windows系统不能安装Pyngl和Pynio的原因。

因此小结一下：安装Pyngl和Pynio需要在linux环境。

但尽管如此，如果你的电脑是Win10版本，那么你仍然可以安装这两个包。方法是

1. 先安装linux子系统；
2. 安装miniconda或者Aanconda环境；
3. 使用conda安装NCL包和PyNgl和PyNio。

如何在windows中的linux子系统上安装呢?

1. 安装linux子系统

• 开启开发者模式。系统设置 -> 更新和安全 -> 针对开发人员 -> 选择开发者模式

点击后会自动安装环境。

• 勾选适用于windows的linux的子系统，点击确定，之后重启电脑。

• 安装Linux子系统，有两种方法安装。第一种是Microsoft store里面直接搜索Ubuntu进行安装。

第二种方法是在win10 命令行内进行安装。Win+R打开cmd，输入bash回车，然后选择y即可安装。

注意：

（1）刚刚安装好Windows 10版本，Linux子系统可能没有处于启用状态。或者安装好linux子系统之后，打开之后输入任意键就闪退了。这时管理员权限的命令提示符（或PowerShell）下输入下面代码，确保子系统可用，然后重启。
Enable-WindowsOptionalFeature -Online -FeatureName Microsoft-Windows-Subsystem-Linux
（2）如果输入bash安装失败，可用lxrun /install /y，即以root登录。

• 初次进入Linux子系统需要设置Linux的用户名及密码。记住输入密码时屏幕上没有显示，这时正常的现象。切换搭配root状态是输入 sudo -s，然后输入密码。
• 更改apt源(选做)。因为Linux子系统的apt源使用的是官方源，需要连接到国外的服务器。所以安装一些软件时下载会很慢，我们可以改用国内的镜像apt源，不改也没有什么问题，不是很影响使用。国内的有阿里源、清华大学源、科大源和网易源，这里推荐科大源。

对原始文件备份：sudo cp /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list.bak

编辑源配置文件/etc/apt/sources.list，可以用vi编辑，讲文本内容替换为：

deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ xenial main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ xenial-updates main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ xenial-backports main restricted universe multiverse
deb https://mirrors.ustc.edu.cn/ubuntu/ xenial-security main restricted universe multiverse

保存运行：sudo apt-get update

2. 安装miniconda或者Aanconda环境

• 下载安装linux版本的miniconda或者anaconda，建议选择更小的miniconda。链接：https://conda.io/en/latest/miniconda.html
• 输入以下命令安装：①bash Miniconda…sh；②source ~/.bashrc 更新bash文件
• 测试安装是否成功，输入conda -V，如果出现相应的版本号即表明安装成功了。

注：默认安装的linux子系统的目录在C:UsersyxkAppDataLocalPackagesCanonicalGroupLimited.Ubuntu16.04onWindows_79rhkp1fndgscLocalStaterootfshome

3. 安装NCL及PyNgl、PyNio

• 安装NCL，输入：conda create -n ncl_stable -c conda-forge ncl，此时可以看见miniconda3envs中出现了一个名为ncl_stable的文件夹，即是ncl的安装包。安装地的。需要调用时，先输入source activate ncl_stable，再输入ncl xxx.ncl即可以执行相应脚本。
• 安装PyNgl、PyNio，参考官网的教程(http://www.pyngl.ucar.edu/Download/ )。

输入：conda create --name pyn_env --channel conda-forge pynio pyngl

或者conda create -n ncl_to_python -c conda-forge xarray netcdf4 scipy pyngl pynio ncl即可。

可发现miniconda3envs下多了pyn_env或者ncl_to_python文件。

调用：需要调用PyNgl、PyNio包的时候，输入source activate pyn_env或source activate ncl_to_python，然后输入python xxx.py脚本即可以运行。

注：有时候发现安装pyn_env和ncl_to_python之后，输入import Nio时报错，如下图：

此时的解决方法是：conda create --name pyn_env --channel conda-forge/label/cf201901 pynio pyngl 来下载pyn_env。至于ncl_to_python目前还没有很好的解决方法。但是ncl_stable+pyn_env的功能=ncl_to_python

• 关于linux子系统运行的疑问：

问题一：找到根目录之后，新建或者复制了文件数据之后，打开ubuntu，为什么输入ls看不到相应的文件？

解答：这个问题确实存在，这是linux 子系统的一个bug。你关闭ubunt终端之后重启，在此打开进入该目录下输入ls，即可以看到新建或者复制的文件了。

总结：有任何文件的更改，特别是通过windows环境下的复制粘贴以及新建的方式，一定得重启ubuntu终端才能生效。

问题二：如何进入C盘或者D盘，输入cd D：会报错，使用cd ../../../一直后退也不行，只能到根目录下面就停止了，那是不是只能在根目录下运行相关程序呢？

解答：要进入其他盘，得输入cd /mnt/。即可以看到各种磁盘了，此时就可以进入C盘/D盘操作了。

问题三：有时候执行cd命令，进入进出文件夹时，都会出现Permission denied问题，这到底是怎么回事？

解答：这是因为权限不够的问题，建议输入sudo -s，进入root命令之后，再去执行相应的命令。但是在root命令下得格外小心哦。

实例运行：

问题：用pynio pyngl读取nc数据，并输出相应的图像

前期处理：①下载数据，仅有7kb

②查看nc数据的属性，了解里面的数组信息，在Python的环境下，可以通过

gdalinfo name.nc 查看

或者

import netCDF4 （得安装netCDF4，可使用pip install netCDF4）

dataset = netCDF4.Dataset('tas_mod1_hist_rectilin_grid_2D.nc')

print(dataset)

如何运行：打开ubuntu——输入source activate pyn_env，进入相应的test目录（包括下载的tas_mod1_hist_rectilin_grid_2D.nc数据和一个test.py脚本，该脚本代码如下）。在该目录下输入python test.py即可运行。

import 

结果：

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